Các tỉnh ĐBSCL đang khuyến khích người nuôi mở rộng liên kết với doanh nghiệp trong quá trình sản xuất và tiêu thụ cá tra (còn gọi là liên kết dọc) vì hình thức này mang lại hiệu quả kinh tế cao, bền vững. Hiện diện tích nuôi cá tra theo hình thức liên kết dọc tại ĐBSCL còn khiêm tốn, chỉ phát triển tại An Giang, Đồng Tháp, Cần Thơ với 563 héc ta,...